我写的软件被公司注册为他们自己的，怎么办？

如果你是公司员工，软件著作权归属需根据合同约定。若未约定，通常归公司所有，但你可以主张署名权。

建议查看劳动合同或相关协议，明确约定软件著作权归属。如未约定，可与公司协商或通过法律途径主张权利。