公司发现员工私设小金库，如何合法追责？

公司应通过内部审计或第三方机构查清小金库的来源和用途，保存相关证据。若员工行为涉嫌违法，可向公安机关报案并追究其法律责任。

在处理过程中，建议公司依法制定内部调查流程，避免侵犯员工合法权益。同时，可与律师合作，起草追责文件或提起民事诉讼。