员工离职后擅自修改公司软件源代码，导致系统无法运行，公司该怎么办？

员工擅自修改源代码可能侵犯公司著作权，公司可依法追究其民事责任，甚至刑事责任。

建议公司及时备份原始代码，评估损失，并通过法律途径要求恢复原状或赔偿损失。