邻居投诉我买的二手房存在违建，我该如何应对相关部门的调查？

您可以向调查部门提供购房合同、产权证明等材料，说明房屋来源，并配合调查核实相关情况。

建议在调查过程中保持沟通，如实陈述事实，并寻求律师协助，确保自身合法权益不受侵害。