总部与加盟商之间因商业秘密侵权产生纠纷，应向哪个法院起诉？

通常应向被告所在地或侵权行为发生地的法院提起诉讼，具体需结合实际情况判断。

建议在合同中提前约定争议解决的管辖法院，以减少诉讼过程中的不确定性并提高效率。