合同中约定对方公司存在税务问题由其自行负责，是否有效？

合同中约定税务责任由对方承担，若内容明确且双方自愿签署，通常具有法律效力。

但若税务问题涉及违法行为，此类约定可能无法完全免除其法律责任，建议在签署前咨询专业律师。