我公司商标被他人注册后，对方还起诉我们侵权，这合理吗？

如果对方注册商标存在恶意，且您公司早于其注册时间使用该商标，对方起诉您侵权可能不成立。

建议尽快收集使用证据，并联系律师准备应诉材料，同时考虑申请宣告对方注册商标无效。