【问题分析】您好,您所提出的是关于*****的问题......,【解决方案】*****【具体操作】*****
公司与船主的纠纷应依据双方签订的合作协议,通过协商或第三方调解解决。
如协商无效,可向有管辖权的法院提起诉讼,或根据协议选择仲裁方式处理。