对方公司声称没收到文件，因此不付款，我该怎么办？

文件是否送达应以证据为准。如果能证明已按合同约定方式送达，对方拒付款项可能缺乏法律依据。

建议通过电话、邮件等方式再次确认对方是否收到文件，并保留沟通证据。若对方仍不付款，可考虑法律途径维权。