员工借款给公司，如何证明这笔借款属于个人债务而非工资？

应通过书面借款协议明确借款性质、金额、还款时间，并与工资发放记录区分开。

建议由公司财务出具相关凭证，并避免将借款与工资混同处理，以减少法律风险。