法院拍卖了我名下的房产，但房产证在配偶手中，我该怎么办？

如果房产存在产权争议，可以向法院提出异议，说明房产证未在本人手中可能影响拍卖的合法性。

建议尽快联系配偶协商房产证的归还，并委托律师协助处理异议和产权确认事宜。