如何证明对方通过非法手段获取我公司的商业机密？

可以通过收集对方接触商业机密的证据、对比信息相似性、调查员工流动情况等方式，证明其获取方式不合法。

建议联系专业律师进行证据保全，并考虑申请法院调查令获取对方内部资料，以增强证据的法律效力。