公司委托我开发软件，但后来不承认是我的作品，还将其注册为他们自己的软件著作权，我该怎么办？

公司未经授权注册他人作品可能构成侵权，您有权要求撤销其登记并主张自己的权利。

尽快向著作权登记机构提交异议申请，并准备相关证据材料，以维护自己的合法权益。