高新技术企业申请专利时，合作方主张共有权怎么办？

专利申请权的归属应以实际研发过程和合同约定为准，合作方主张共有需提供相应证据。

建议企业保留研发过程的完整记录，并在申请前与合作方确认权属，必要时可进行公证或律师见证。