农村宅基地房屋转让合同被认定无效后，如何处理已支付的房款？

如果合同因违反宅基地使用规定被认定无效，双方应协商返还已支付的房款，若协商不成，可向法院提起诉讼。

在诉讼过程中，需提供相关证据证明合同无效的原因，以及款项支付的具体情况，以保障自身权益。