我在工作中创作的软件被公司申请了专利，我该怎么办？

根据法律规定，职务发明的专利权通常归属于单位。但您作为发明人，有权获得相应的奖励和报酬，可以与公司协商确认您的权益。

如果公司未履行相关义务，您可以向劳动仲裁机构或法院提出主张，要求确认发明人身份并获得应得的经济补偿。