公司让我开发软件，但后来声称软件是他们自己写的，我该如何证明是我的作品？

你可以通过提交原始代码、开发日志、项目计划书等材料来证明你是软件的实际创作者。

建议尽快进行软件著作权登记，并与公司沟通确认权属，避免后续纠纷升级。