商业合作中，如何处理因垄断协议导致的合同无效问题？

若合同因垄断协议被认定为无效，双方需承担相应的法律后果，包括返还已支付款项和赔偿损失。

建议在合同中加入合法性条款，明确约定若协议内容违法，双方可协商修改或终止合同，以减少损失。