签订的运输合同中未明确海盗风险责任，如何处理损失？

合同未明确海盗风险责任时，可根据合同性质和行业惯例判断责任方，必要时可申请仲裁或诉讼。

建议在合同中补充海盗风险条款，明确责任归属和赔偿方式，以减少后续争议。