员工否认公司为其垫付的借款，公司该如何追回资金？

公司可以提供借款记录、审批流程、员工签字等证据，主张该借款为员工个人债务。

建议通过公司内部制度明确借款流程，并在借款发生时要求员工签署书面确认文件。