商业秘密侵权案件中，如何应对对方的证据保全申请？

公司可提供证据证明自身未侵犯商业秘密，或申请法院对自身证据进行保全，以防止证据被篡改或灭失。

建议公司提前整理好相关文件和数据，必要时可申请公证或第三方机构协助保存关键证据。