渔船在公海捕鱼时被他国船只误认为海盗，如何处理？

应通过外交途径澄清事实，提供渔船的合法身份证明和作业记录，避免因误解引发不必要的法律后果。

建议在船上安装国际通用的识别系统，并在航行时保持通讯畅通，以减少被误判的可能性。