我公司开发的软件被他人盗用，如何保护自己的权益？

可以向法院提起著作权侵权诉讼，要求对方停止使用并赔偿损失，同时可申请证据保全。

建议在软件发布前进行著作权登记，并保留开发过程中的原始代码和文档，作为维权的重要证据。