对方说已经支付版权费，但我没收到，这种情况可以申请仲裁吗？

对方声称已支付版权费但你未收到，可以依据合同约定申请仲裁，要求其履行付款义务。

建议查看合同中约定的付款方式，并保留沟通记录，作为仲裁或诉讼的证据。