公司被控非法经营，是否可以申请不起诉？

如果证据不足以证明公司构成非法经营罪，或行为情节显著轻微，可以依法申请检察机关作出不起诉决定。

申请不起诉需在审查起诉阶段提出，并提供充分的法律依据和证据支持，建议由专业律师代理。