公司是否可以单方面将员工开发的软件申请为自有版权？

公司若能证明软件开发属于员工的职务行为，通常有权申请版权，但需保障员工的合法权益。

员工如认为公司行为不当，可向版权登记机构提出异议，并提供相关证据支持自己的主张。