非法经营罪的调查中，公司如何保护自身权益？

公司可通过律师申请查阅调查依据，对查封、扣押等措施提出异议，并确保员工和管理层在配合调查时避免提供不实信息。

建议公司建立内部调查小组，梳理相关业务流程和文件，为律师提供清晰、完整的资料支持。