我在工作中被领导要求签署借款协议，事后才知道是共同借款人，可以申请劳动仲裁吗？

如果签署借款协议是基于领导的不当指令，且该行为与工作职责无关，你可以通过劳动仲裁主张相关权益。

建议先与公司沟通，要求撤销协议或提供合理解释，若无法解决，可向劳动仲裁机构提交申请。