公司被恶意起诉，如何通过对方的商业行为证明其不正当动机？

可以通过对方在行业内的历史行为、是否存在商业诋毁或垄断行为，来判断其起诉是否具有不正当目的。

建议委托第三方机构进行商业背景调查，并将调查结果作为法律抗辩的依据，同时与律师共同制定应对策略。