员工因职务犯罪被调查，公司如何处理其工资和社保？

公司应依法暂停发放与职务犯罪相关的绩效或奖金，但基本工资和社保仍需按法律规定缴纳，除非员工被依法限制人身自由。

建议在处理过程中与劳动部门沟通，确保操作符合劳动法规定，同时避免因处理不当引发劳动仲裁。