合作开发的软件被对方单方面注册了著作权，我该怎么办？

合作开发的软件著作权归属应依据合同约定，若合同未明确，可能需要通过证据证明您的贡献和合作事实。

建议尽快联系律师，准备相关证据材料，如沟通记录、开发分工协议，以主张您的合法权益。