高新技术企业被侵权指控后，如何保护自己的核心技术？

企业应尽快对自身技术进行专利布局，确保核心技术的合法保护。同时，建立完善的研发记录和保密制度，以应对可能的法律争议。

可以对研发过程进行公证，保存技术开发的原始文档，并对员工签署保密协议，防止技术泄露，从而在法律上维护自身权益。