合作公司未按约定支付货款，是否可以申请仲裁追讨？

如果双方在合同中约定了仲裁条款，对方未支付货款属于违约，可以依法申请仲裁。

建议先发函催告对方履行付款义务，若无效再准备相关材料向仲裁机构申请。