公司安全生产违规被立案调查，如何应对才能减少损失？

企业应主动配合调查，及时整改问题，并提供相关证据以证明其已尽到合理管理义务。

同时，建议企业内部召开合规会议，明确责任分工，防止类似问题再次发生。