公司被控商业秘密侵权，如何证明自己没有非法获取行为？

可以通过提供研发记录、技术来源证明、第三方授权文件等方式，证明相关技术或信息是独立开发或合法获得的。

建议保存所有与技术开发相关的邮件、会议记录、合同等资料，并由专业律师协助整理，形成完整的证据链。