我与出版社签订的合同中未明确小说版权归属，现在他们擅自修改内容，我该怎么办？

如果合同中未明确版权归属，通常默认作者保留著作权。您可以主张对方未经授权修改作品的行为构成侵权。

建议尽快与出版社沟通，要求其恢复原稿内容，并考虑通过律师发函或提起诉讼维护自身权益。