合作开发的软件被对方擅自商用，能索赔吗？

如果合作开发协议中约定了著作权归属和使用权限，对方擅自商用可能构成违约和侵权，可以要求赔偿。

建议先与对方协商解决，若协商不成，可依据合同约定提起诉讼或仲裁，主张经济损失和合理费用。