我在工作中开发的软件被公司注册为专利，我是否可以主张署名权？

如果你是软件的主要发明人，通常可以主张署名权，但需提供相关证据证明你的贡献。

建议与公司沟通，要求确认你的发明人身份，并在必要时寻求法律支持。