被控职务侵占但实际是公司内部管理混乱导致的，该怎么处理？

可以主张因公司管理制度不健全导致的误解或错误指控，提供相关管理漏洞的证据。

建议收集公司内部流程混乱的资料，如审批不规范、账目不清等，提交给辩护律师进行策略制定。