员工离职后，公司以保密协议为由扣发工资，是否合理？

保密协议不能成为拖欠工资的理由。员工有权获得其应得的劳动报酬。

建议员工与公司协商，若公司仍拒绝支付工资，可向劳动监察部门投诉或申请仲裁。