宅基地转让协议无效，如何处理已建房屋的归属问题？

如果宅基地转让协议无效，但房屋已建成，房屋的归属问题需根据出资、建设情况和实际居住情况综合判断。

建议通过协商解决，协商不成可向法院提起诉讼，明确房屋权属及分割方式。