公司未按合作协议支付款项，对方能索赔间接损失吗？

如果因未支付款项导致合作方间接损失，如业务中断或客户流失，可依据协议约定和实际影响要求赔偿。

建议先发送律师函催告履行义务，并保留相关损失的书面证据，为后续法律程序做准备。