公司被起诉违约，但实际已履行合同义务，如何自证清白？

可通过提供合同履行的证据，如交付凭证、验收单、沟通记录等，证明公司已按约定完成义务。

建议整理所有相关证据材料，由律师协助向法院提交，以反驳对方的指控并维护公司权益。