合同履行的时候双方对部分条款的理解有争议，一般怎么认定条款的真实意思？

这种情况属于合同履行过程中正常的争议情形，本身不违反任何法律规定，只要双方签订的合同不存在违反法律强制性规定、公序良俗或者恶意串通损害他人利益等无效情形，争议条款依然属于有效合同的组成部分，不会因为双方理解分歧就直接失去效力或者导致整个合同无效。

你可以先结合合同使用的词句、整体条款内容、双方签订合同的目的以及日常交易习惯，本着诚实信用的原则自行梳理协商；如果合同是格式文本，对格式条款有不同理解的，法律规定要作出不利于提供格式条款一方的解释，如果双方自行协商无法达成一致，可以提请人民法院或者仲裁机构来对条款作出正式解释。