合作方以现金支付知识产权使用费，后否认支付金额，如何维权？

应保留支付时的收据、转账记录、协议文本等材料，以证明使用费已支付。

若无书面协议，可尝试通过邮件、短信、微信等沟通记录来辅助证明支付事实。