高新技术合作开发后，一方擅自申请专利怎么办？

如果合同中已明确约定专利归属，对方擅自申请可能构成违约。可依据合同约定主张权利，要求撤销或共享专利。

建议及时收集证据，如合作过程中的技术资料、沟通记录等，必要时通过法律途径维护自身合法权益。