合作开发高新技术项目，是否需要在协议中约定知识产权的后续使用？

是的，明确知识产权的后续使用范围和方式，有助于减少合作后的争议。

建议在协议中详细说明是否允许合作方继续使用成果，以及使用条件和限制。